1、曹操多次写信给华佗催他回去，甚至让当地县令找到华佗，请他回曹操，但华佗以妻子身体不好为由拒绝了。于是恼羞成怒的曹操派人到华佗老家把他抓回来。
2、被捕后，华佗受到严刑拷打。曹操坚持要华佗为他效力，但华佗始终坚定不移，不肯让步。最终曹操下令处死华佗。很多人为华佗求情，认为他医术更高，被处死很可惜。但曹操置之不理，华佗被曹操处死。
3、但历史上广为流传的说法是，华佗治好曹操的头痛病后，曹操担心日后会复发，便强行将华佗留在身边，华佗被处死。而《三国演义》年对华佗死因的解释是，华佗认为要治好曹操的头痛，就要把他的头剖开除去头里的风涎，这样才能治好。但曹操以为华佗想杀他，就把华佗关进监狱，后来杀了他。
4、华佗是怎么死的，至今没有明确的答案。有人说，华佗是在试图治好曹操的头痛时被毒死的。
5、755-79000年有记载，华佗在给曹操治病的时候，过了约定的期限也不回去，导致曹操大怒，下令处死华佗。所以不管华佗怎么死，都和曹操有很大关系。
