政府机构改革后，随着畜牧、水产、农机政府职能的划入，北京市农业局成为主管本市种植业、畜牧业、水产业和农业机械化工作的市政府直属机构，承担着农业行政执法、科技推广、质量检测和信息服务等方面的职能。
2000年，北京市农业局的科技人员和干部、职工为全面提高郊区农业整体水平，大力推进农业结构战略性调整，加快农民增收步伐，使郊区农业实现“九五”计划的战略目标做出应有的贡献。
信息技术的蓬勃发展以及商业化的进程从根本上改变了各行业的运营模式。特别是政府职能部门的信息化程度，从某种意义上决定了工作效率、服务水平和综合能力。北京市农业局领导充分认识到这一点，正如相关负责人所说“加强信息化建设是北京市农业局现阶段的工作重点之一，北京市农业局组建了专门的领导小组，用了相当长的一段时间，经过严谨的调查筛选，最终选择了国内最大的管理软件厂商用友ERP-NC产品，能充分符合公司发展的要求，希望通过此次强强联手，进一步提升北京市农业局的信息化管理水平，从而更好的为广大农民朋友服务。”
此次北京市农业局携手用友软件，更进一步提升了作为政府职能部门的工作效率，从而有力推动了其信息化建设进程；这也是用友软件继与北京市地税局、北京市工商行政管理局、北京市药品监督管理局等部门牵手之后又一次与政府职能部门合作。
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