近年来，通过建立健全内控机制，严格规范操作流程，风险防范意识有所加强，会计核算与管理的质量得到了较大提高。但是内控制度管理中依然存在一些不可忽视的问题。特别是面对复杂的社会环境和激烈的同业竞争，如何建立起一套行之有效的内部控制系统，并在实际工作中加以应用，是我们面临的重要课题。
建立科学有效的内控机制，完善内控制度，应着重做好以下几方面工作：
强化制度建设，坚持全面性、及时性原则。针对综合业务系统，重新梳理临柜工作流程，建立岗位责任制，明确每个岗位的工作范围、职责和权限，实行定岗、定责，促使他们各司其职，各负其责，相互监督。对重点岗位实施重点监控，在开办新业务时，做到制度先行，树立内控优先的思想。
提高人员素质，加强队伍建设。在强化管理的同时，必须注重人的道德品质、政治理论教育，只有把会计人员的思想工作做好了，即便会计制度中有不完善的地方，管理中还有不到位的地方，隐患也会及时被发现并得到控制。因此要采取各种形式提高人员思想素质、业务素质及业务技能。
加大科技投入，提高内控的技术含量。综合业务上线后，每个核算单位都配备一个事后监督员，但只是看看传票，检查要素的遗漏，检查内容只局限于表面现象，这些都是不能被允许的。只有开展与综合业务系统相配套的事后监督程序，由软件程序进行控制，才能真正实现事后监督的功能。综合业务系统中还有一些不完善的地方，如进行柜员权限的修改，柜员的修改、删除、授权授信、出纳钱箱的修改等都没有打印信息。对这些交易的操作，都应有相应的打印资料，记载时间、操作员、授权人等信息，这对于明确责任就有据可查了。
内控制度建设的系统性、连续性、动态性还有待加强。目前的内控制度很多方面还局限于对原有制度的补充和修订，往往是风险发生后制订了一些规章和制度，前瞻性不足。对风险点和薄弱点还要加大控制力度，确保会计内控制度渗透在会计工作的各项业务过程和各个操作环节中，覆盖所有的部门和岗位。金融时报·张建宏
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