1.原始凭证的审核。对会计电算化的原始凭证审核，仍采用手工方法，即对每张原始凭证进行认真审核。内容包括填制凭证日期、填制凭证单位或填制人姓名、接受凭证单位名称、经济业务内容、数量、单价和金额等，必要时进行调查核对，考核其是否合理合法、有无涂改现象，是否符合有关财务制度的规定，是否违反了国家的方针、政策和法规等。
2.记账凭证的审核。要保证会计电算化的结果正确，对输入到计算机里的凭证进行认真审核是关键。其方法是先审核记账凭证是否正确，包括填制凭证日期、凭证编号、原始凭证附件张数、经济业务内容摘要、会计科目或编号、金额等，做到会计科目使用正确，数字准确无误。其次审核转账凭证是否正确，内容是否相符。最后审核打印输出记账凭证上的制单人员、审核人员、记账人员是否正确，是否加盖了出纳、会计机构负责人或会计主管人员的印章。
二、会计账簿的审核
会计账簿包括总账、明细账、日记账和其他辅助性账簿。在会计电算化条件下，均采用活页式账簿。现在财务软件中，大多采用在同一个功能模块中通过机内会计凭证审核后直接或成批登记总账和明细账。对会计账簿的审核主要看结账前输入的会计凭证是否全部入账、会计数据是否及时备份、总分类账户发生额及余额对照表和明细分类账余额是否相符、账簿是否定期打印、打印的格式和内容是否符合国家统一会计制度的要求、输入银行对账单后机内是否自动生成银行存款余额调节表等。
三、会计报表的审核
会计报表的审核重点审查报表软件程序，包括会计报表的格式、项目、各项目的数据来源、表内和表间的数据运算和核对关系是否正确。其方法‘首先应用原程序备份盘与使用中的核算软件程序进行比较，看是否一致，以防止使用中的程序被修改等。在一致的基础上，用一套事先准备的模拟数据核审、测试核算软件是否正确。其次，会计电算化报表的数据正确与否，关键看报表的取数公式。如果公式有误，从技术上即可判定自动生成的报表数据存在问题；如果公式无误再看账核对，如果不符，说明报表数据已经过技术处理，或不是自动生成的，很可能是用键盘输入的。再次，看会计报表附件和财务情况说明书是否执行国家统一的会计制度规定，对需要说明的事项作出内容完整、数字真实、计算正确的说明。最后，看对外报送的会计报表是否依次编定页码，加具封面，装订成册，加盖公章。封面上是否注明单位名称、单位地址、财务报告所属年度、季度、月度，送发日期和单位领导人、总会计师、会计机构负责人、会计主管人员、制表人员是否已签名或盖章。
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