【摘要】：膜蛋白是一类结构独特的蛋白质,是细胞执行各种功能的物质基础。根据其在细胞膜上的不同存在方式,主要分为六种类型。本文利用压缩的氨基酸对原始膜蛋白序列进行信息压缩,再对压缩序列进行氨基酸组成和顺序特征的提取,最后采用支持向量机构建分类模型。通过五叠交叉验证的结果表明,该方法对于六种膜蛋白的分类预测,准确度最高可达98%以上,平均预测准确度在85%以上,可有效实现膜蛋白六种类型的划分,为进一步分析膜蛋白的结构和功能奠定基础。
【关键词】： 膜蛋白 压缩氨基酸 支持向量机
【正文快照】：
膜蛋白是一类结构独特的蛋白质,它处于细胞与外界的交界部位,是细胞执行各种功能的物质基础,同时也是很多药物作用的靶点,如最典型的G蛋白偶联受体家族,它虽然只占人类基因组编码序列的1%,但在药物研发中却有60%~70%的目标蛋白是G蛋白偶联受体家族成员[1]。目前随着基因组学和
【参考文献】
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1 姜彬;王正华;王勇献;贺细平;;k子串离散源结合加权KNN算法预测膜蛋白类型[J];激光生物学报;2009年01期
2 张树波;赖剑煌;;蛋白质亚细胞定位预测的机器学习方法[J];计算机科学;2009年04期
3 张绍武;潘泉;程咏梅;施建宇;;基于一种新的特征提取法和支持向量机的膜蛋白分类研究[J];计算机与应用化学;2006年04期
4 张光亚;葛慧华;方柏山;;基于不同序列特征值预测氧化还原酶辅酶类型的研究[J];计算机与应用化学;2008年05期
5 苑津莎;张利伟;王瑜;尚海昆;;基于极限学习机的变压器故障诊断方法研究[J];电测与仪表;2013年12期
6 张凯;赵建虎;王锲;;基于支持向量机的水下地形匹配导航中适配区划分方法研究[J];大地测量与地球动力学;2013年06期
7 周任军;赵慧材;方昀晖;刘巍;;采用支持向量机图形用户界面的电力负荷组合预测方法[J];电力科学与工程;2013年12期
8 郝理阳;潘泉;;基于融合核方程对药物-靶点作用预测研究[J];电子设计工程;2013年23期
9 王文;王成刚;李建海;杨帆;;基于SVR的电工实验装置故障预测方法研究[J];电气电子教学学报;2013年06期
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